Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EGFRP00533 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EGFRP00533 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EGFRP00533 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EGFRP00533 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EGFRP00533 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms