Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC24BO95487 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC24BO95487 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms