Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJB5O95377 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJB5O95377 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJB5O95377 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB5O95377 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB5O95377 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB5O95377 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB5O95377 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB5O95377 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms