Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCAF4O95104 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCAF4O95104 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms