Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3JO75822 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3JO75822 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms