Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP9AO75110 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP9AO75110 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms