Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN3BO60391 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIN3BO60391 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms