Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SUSD5O60279 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SUSD5O60279 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms