Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NDUFS5O43920 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms