Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DENRO43583 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DENRO43583 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DENRO43583 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DENRO43583 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DENRO43583 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DENRO43583 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DENRO43583 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms