Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA2O43364 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXA2O43364 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms