Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRTM2O43300 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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