Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP3O43295 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP3O43295 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP3O43295 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms