Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GPAA1O43292 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPAA1O43292 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms