Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CRXO43186 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CRXO43186 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CRXO43186 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CRXO43186 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRXO43186 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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