Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLIM4O00461 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLIM4O00461 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms