Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3BA8MYP8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms