Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MVJ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MVJ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MVJ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MVJ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms