Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC169A6NNP5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC169A6NNP5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms