Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GOLGA6CA6NDK9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms