Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L4A6NCW7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms