Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VWA3AA6NCI4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VWA3AA6NCI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms