Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms