Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMIM30A4D0T7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMIM30A4D0T7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM30A4D0T7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM30A4D0T7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM30A4D0T7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMIM30A4D0T7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms