Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC78A2IDD5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC78A2IDD5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms