Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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