Protein–RNA interactions for Protein: S4R325

URGCP-MRPS24, URGCP-MRPS24 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-MRPS24S4R325 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
URGCP-MRPS24S4R325 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms