Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A4Q9Y6R1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms