Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TSSC4Q9Y5U2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms