Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB2Q9Y5E7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms