Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HES2Q9Y543 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HES2Q9Y543 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms