Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRRAPQ9Y4A5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRRAPQ9Y4A5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRRAPQ9Y4A5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TRRAPQ9Y4A5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRRAPQ9Y4A5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms