Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PKP3Q9Y446 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PKP3Q9Y446 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms