Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TPRKBQ9Y3C4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TPRKBQ9Y3C4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms