Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SBNO2Q9Y2G9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SBNO2Q9Y2G9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBNO2Q9Y2G9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms