Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATF5Q9Y2D1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms