Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUDCQ9Y266 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms