Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNND2Q9UQB3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms