Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1RE1Q9UN81 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms