Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRID1Q9ULK0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRID1Q9ULK0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms