Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN2Q9ULH4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms