Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms