Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCP2D1Q9UJQ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms