Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
STAG3Q9UJ98 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
STAG3Q9UJ98 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms