Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms