Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAX2Q9UIW0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAX2Q9UIW0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms