Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHORDC1Q9UHD1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms