Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP68Q9UHB9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms