Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX2Q9UBZ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms