Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUCLA2Q9P2R7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUCLA2Q9P2R7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms